Arachis, seca, Meloidogyne, miRNAs, bioinformática
É previsto que as mudanças climáticas em curso irão intensificar a ocorrência de eventos climáticos extremos e agravar o impacto de pragas e patógenos sobre a produção agrícola, colocando em risco a segurança alimentar de uma população em contínuo crescimento. Dentro deste contexto, a cultura do amendoim apresenta grande relevância por constituir importante fonte nutricional, sendo cultivada, predominantemente, em trópicos semiáridos por agricultores com poucos recursos. O déficit hídrico e a infecção por nematoides das galhas (Meloidogyne spp.) representam condições de estresse que impõe significativas limitações à produtividade e qualidade da produção de diversas culturas agrícolas, incluindo a espécie cultivada de amendoim (Arachis hypogaea), a qual apresenta alta suscetibilidade a tais condições. Por outro lado, seus parentes silvestres apresentam maior tolerância/resistência a estresses abióticos e bióticos e o estudo dos mecanismos de resposta ao estresse destas espécies pode contribuir tanto para aprofundar o conhecimento sobre processos regulatórios, vias de sinalização e proteínas associadas como para o descobrimento de alelos ligados à tolerância/resistência, os quais podem ser utilizados em programas de melhoramento ou para o desenvolvimento de aplicações biotecnológicas. Dentre os mecanismos de controle da expressão gênica, a regulação pós-transcricional realizada por microRNAs, uma classe de pequenos RNAs regulatórios, exerce papel fundamental nos processos de crescimento, desenvolvimento e resposta a condições de estresse abiótico e biótico em organismos vegetais. No presente estudo, a fração de pequenos RNAs de amostras de tecidos radiculares de plantas de Arachis duranensis submetidas à diminuição gradual de água no solo ou inoculadas com juvenis J2 da espécie Meloidogyne arenaria foram sequenciadas (sRNA-Seq) e os dados resultantes foram analisados com o objetivo de identificar loci MIR conservados e inéditos, verificar loci MIR diferencialmente expressos e predizer os genes alvo putativos de loci MIR identificados. Foram identificadas 32 famílias conservadas de miRNAs e 21 loci MIR inéditos, com a predição de genes alvo putativos para a maioria dos loci identificados. A análise da expressão diferencial revelou cinco famílias de miRNAs conservados e um locus MIR inédito diferencialmente expressos em amostras inoculadas com juvenis J2 da espécie M. arenaria, enquanto 18 famílias de miRNAs conservados e cinco loci MIR inéditos foram diferencialmente expressos em amostras submetidos a déficit hídrico. Sob infecção por nematoides das galhas, as principais vias metabólicas influenciadas pelos miRNAs diferencialmente expressos estão relacionadas à biossíntese de ácido jasmônico (JA), à via de sinalização de auxinas (AUX) e a modificações da estrutura da parede celular, como, por exemplo, lignificação e hidrólise de polissacarídeos componentes da matriz de pectina. Sob diminuição gradual do conteúdo de água no solo, as principais vias metabólicas influenciadas pelos miRNAs diferencialmente expressos estão relacionadas à via de sinalização dependente de ABA, à via de sinalização independente de ABA, à via de sinalização de auxinas e à homeostase redox intracelular. Além da identificação de novos loci MIR, provavelmente espécie específicos, os resultados obtidos pelo estudo podem servir como referência para posteriores estudos sobre mecanismos regulatórios em espécies de Arachis e para o desenvolvimento de aplicações biotecnológicas visando a tolerância/resistência a estresses.