Banca de QUALIFICAÇÃO: Isabel Cristina Cunha Ferreira

Uma banca de QUALIFICAÇÃO de DOUTORADO foi cadastrada pelo programa.
DISCENTE : Isabel Cristina Cunha Ferreira
DATA : 23/02/2023
HORA: 10:00
LOCAL: Auditório Maristela
TÍTULO:

"CARACTERIZAÇÃO TAXONÔMICA E FUNCIONAL DE LINHAGENS BACTERIANAS OBTIDAS A PARTIR DO USO PEPTÍDEOS ANTIMICROBIANOS COMO MECANISMO DE SELEÇÃO." 

PALAVRAS-CHAVES:

prospecção, linhagens bacterianas, atividade antibacteriana

PÁGINAS: 90
RESUMO:

A resistência a antibióticos desenvolvida por bactérias tem sido uma ameaça crescente para o tratamento eficaz de de infecções causadas por esses micro-organismos. Há então uma necessidade de descoberta de novos antibacterianos que substituam aqueles que se tornaram ineficazes. As limitações das técnicas clássicas de cultivo e dos métodos independentes de cultivo para a prospecção de micro-organismos dificulta a descoberta de novos micro-organismos produtores de antimicrobianos. Assim, há a necessidade de avanços na busca por novas tecnologias direcionadas à obtenção de micro-organismos produtores de antimicrobianos e outras atividades de interesse. O desenvolvimento de antimicrobianos exige uma série de etapas, onde a primeira é a descoberta e caracterização de micro-organismos com potencial biotecnológico. Assim, este estudo está organizado em dois capítulos, onde o primeiro descreve a metodologia para a prospecção de linhagens bacterianas com potencial para a produção de compostos antimicrobianos, através do sobrenadante de Paenibacillus elgii e no segundo, as linhagens obtidas a partir da metodologia proposta no primeiro e que obtiveram resultados positivos em testes para atividade antibacteriana foram caracterizados genotípica e fenotipicamente. Meios de cultura foram enriquecidos com sobrenadante de cultura de P. elggi que é rico em peptídeos antimicrobianos. Amostras de solo foram inoculadas nestes meios afim de selecionar apenas bactérias resistentes àquele sobrenadante e, por isso, com potencial para a produção de compostos similares. Linhagens bacterianas obtidas através deste protocolo foram testados quanto a sua capacidade antibacteriana. Uma vez constatada a atividade antibacteriana para Escherichia coli, Bacillus subtilis e Pseudomonas. aeruginosa, as linhagens foram identificadas por Sequenciamento Sanger do gene rRNA 16S e caracterizadas fenotipica e genotipicamente. As linhagens denominadas B7 e C6 tiveram seus genomas sequenciados em Illumina e Oxford Nanopore Technologies. A classificação taxonômica baseada em genomas mostrou que a linhagem mais próxima de B7 é Kitasatospora xanthocidica (dDDH 32,8-37,8% e ANI 86,86%) indicando que pode ser uma nova espécie. Já C6, confirmou-se ser Methylobacterium radiotolerans (dDDH 90,3-94% e ANI 97,51%). Em relação a anotação funcional dos genomas, 49 clusters gênicos foram detectados para o isolado B7 e 9, para C6. Dentre eles, destaca-se o cluster NRPS (nonribosomomal peptide synthase), presente em ambos isolados e o mais abundante em B7. As enzimas do tipo NRPS são responsáveis pela produção de peptídeos não ribossomais, muitos deles com atividade antibacteriana, como as pelgipeptinas¸ oriundas de P.elgii. Destaca-se também 4 clusters, em B7, ligados à produção de lantipeptídeos, mesma classe de bacteriocinas das elgicinas, em P.elgii. A presença de tais grupos de genes pode indicar a produção de compostos semelhantes entre as linhagens B7 e C6 e P.elgii. A plataforma CAMPR4 para predição de peptídeos antimicrobianos identificou 59 predições, em B7, e 40, em C6, todas com probabilidade superior a 0,68 (escala de 0 a 1). A plataforma BAGEL4 reconheceu 8 regiões envolvidas na biossíntese de peptídeos sintetizados ribossomalmente e modificados póstranslacionalmente em B7. Este estudo atestou a eficiência do uso de peptídeos antimicrobianos para seleção de micro-organismos com potencial biotecnológico.

MEMBROS DA BANCA:
Presidente - 2222088 - ELIANE FERREIRA NORONHA
Externo à Instituição - FABYANO ALVARES CARDOSO LOPES - UFT
Externa ao Programa - 2221665 - LIDIA MARIA PEPE DE MORAES
Interno - 2644635 - ROBERT NEIL GERARD MILLER