"Caracterização de microRNAs na interação Musa acuminata-Pseudocercospora musae"
Sigatoka Amarela, Musa, microRNAs, estresse biótioco, Illumina
MicroRNAs endógenos (miRNAs) são pequenos RNAs não codificantes que regulam a expressão gênica a nível pós-transcricional por clivagem ou repressão da tradução de um mRNA. Os miRNAs em plantas regulam diversos processos celulares, incluindo respostas de defesa a estresses bióticos. A bananeira (Musa spp.), é uma cultura monocotiledônea cultivada principalmente nas regiões tropicais, é suscetível a inúmeras doenças devido a sua esterilidade e a baixa variabilidade genética. Pseudocercospora musae, é o agente etiológico da Sigatoka, caracterizada por manchas foliares, é um importante fungo patogênico da bananeira, causando perdas devido à redução da área foliar. As amostras de RNA de folhas foram extraídas de Musa acuminata subsp. burmannicoides, var. Calcutá 4 (resistente), aos 3 e 12 dias após a inoculação (DAI) com conidiósporos. Após a construção de uma pequena biblioteca de RNA, as amostras foram sequenciadas usando a tecnologia lllumina HiSeq 2500. As sequências de alta qualidade foram mapeadas contra M. acuminata ssp. malaccensis var. Pahang. O genoma de referência de Pahang e os miRNAs de plantas foram preditos usando os programas Mireap e ShortStack. Um total de 228 miRNAs conservados pertencentes a 30 famílias de miR foram identificados, juntamente com 22 novos miRNAs preditos. Em 3DAI, 48 miRNAs de 25 famílias de miR mais dois novos miRNAs foram significativamente diferencialmente expressos entre as amostras inoculadas e de controle. Em 12DAI, 31 miRNAs de 18 famílias de miR diferentes e dois novos miRNAs foram regulados após a inoculação. Os potenciais genes alvos do hospedeiro de miRNAs foram preditos usando TargetFinder. A caracterização de miRNAs em M. acuminata e seu papel na modulação da expressão gênica durante a interação com P. musae fornece recursos para o desenvolvimento de métodos eficientes de controle da Sigatoka Amarela.