Caracterização e classificação de epítopos de anticorpos monoclonais selecionados por Phage Display com potencial neutralizante anti-SARS-CoV-2.
Anticorpos, SARS-CoV-2, RBD, caracterização, citometría de fluxo e mapeamento de epítopos.
O documento descreve um projeto de pesquisa que inicialmente buscava gerar anticorpos monoclonais com atividade antifúngica específica para a proteína Kre2 de Paracoccidioides lutzii a partir da construção de uma biblioteca sintética, inserido no macroprojeto PRONEX- “Estratégias de desenvolvimento de drogas antifúngicas: hit to lead e anticorpos monoclonais contra alvos moleculares”. Devido a determinadas situações durante o processo de pesquisa, além da afetação direta na execução dos experimentos pela pandemia da COVID-19, dito empenho não teve sucesso. A abordagem mudou para o desenvolvimento de anticorpos monoclonais para o COVID-19 dentro do macroprojeto “Anticorpos na terapia da COVID-19: estudo clínico de fase IIa, com plasma de convalescentes e geração de anticorpos monoclonais humanos”, em colaboração com a Fundação Hemocentro, o Hospital Universitário de Brasília (HUB) e o Hospital Regional da Asa Norte (HRAN). Os anticorpos foram selecionados pelo método de Phage Display a partir de RNA extraído de plasma de pacientes convalescentes. Foram produzidos e purificados 27 anticorpos no formato scFv, e após análise de resultados de diferentes testes de ligação e bloqueio por citometria de fluxo a diferentes variantes de interesse, circundantes e de preocupação mundial, finalmente foram selecionados 06 anticorpos distintos com sequencias únicas, e caraterizados como classe 1 e clonotipos 2. Estes também são conhecidos como colonotipos públicos IGHV3-53/3-66 com características de neutralização especificas, se-ligando a múltiplos locais vulneráveis do vírus na sua região RBD. Assim, os achados obtidos viabilizaram destacar a importância das mutações somáticas na capacidade de ligação e neutralização dos anticorpos. Este dado foi confirmado com a identificação dos epítopos destes anticorpos, processo que permitiu conhecer o local de ligação no RBD, especificamente em sua região RBS, e hipotetizar a possível forma de ligação dos mesmos a partir de estudos de alinhamento de sequências com anticorpos com alto percentagem de identidade e com estruturas descritas. A partir do conseguido aqui, os próximos passos implicariam continuar desenvolvendo uma estratégia combinatória que envolva a especificidade e funcionalidade dos anticorpos, e a geração de anticorpos específicos contra o SARS-CoV-2 no formato IGG1.