Banca de DEFESA: Macária Ferreira Duarte

Uma banca de DEFESA de DOUTORADO foi cadastrada pelo programa.
DISCENTE : Macária Ferreira Duarte
DATA : 27/04/2023
HORA: 14:00
LOCAL: Meio virtual
TÍTULO:

Análise metagenômica de sequências de vírus de plantas em água de esgoto e caracterização da ORFN1 putativa do pepper ringspot virus

PALAVRAS-CHAVES:

High throughput sequencing, viroma de esgoto, Pepper ringspot virus, localização intracelular

PÁGINAS: 92
RESUMO:

O estudo de virus é de extrema importância para a sociedade, pois compreende o estudo organismos responsáveis por causar inúmeras doenças. O monitoramento regular de vírus isolados de culturas é muito importante com relação a virologia de plantas. A identificação rápida e precisa de vírus potencialmente perigosos pode prevenir surtos graves em culturas de importância econômica. Atualmente, as tecnologias de High Throughput Sequencing (HTS) tornaram-se uma ferramenta acessível e poderosa para essa finalidade. Neste estudo, avaliamos o uso de amostras de águas residuais para monitorar vírus de plantas usando análise HTS e RT-qPCR. Vírus de plantas pertencentes a 12 famílias de vírus foram encontrados, dos quais Virgaviridae, Solemoviridae, Tymoviridae, Alphaflexiviridae, Betaflexiviridae, Closteroviridae e Secoviridae foram os mais abundantes com mais de 20 espécies. Além disso, um virus quarentenário e uma nova espécie de tobamovírus também foram descobertos. Também foi analisada a relevancia de alimentos processados como fonte desses virus em águas residuais. O Pepper tobamo mild mottle virus (PMMoV) foi detectada em abundância em amostras de alimentos processados à base de pimenta e amostras de esgoto, e o Common garlic latent carlavirus (GarCLV) foi detectado em menor quantidade em amostras de alho seco e fresco e amostras de esgoto. Isso mostrou uma alta correlação entre a abundância viral no esgoto e nas fontes de alimentos processados. O uso potencial de águas residuais para pesquisa de vírus é discutido neste estudo. Além do monitoramento de virus, também é de grande importância o estudo de virus já conhecidos que também podem ter importância econômica não apenas no quesito fitossanitário, mas também tecnológico como o uso de vetores de expressão. O pepper ringpot virus (PepRSV) até o momento é o único tobravírus relatado no Brasil. Ele vem sendo usado como vetor viral para produção de proteínas recombinantes. Porém, por ser um virus restrito ao Brasil, ainda é um virus pouco estudado quando comparada a outras espécies também utilizadas para este fim. Este trabalho também apresenta como objetivo o estudo de uma putativa nova ORF N1 do PepRSV, para isso construções mutantes da ORF N1 foram agroinfiltradas em folhas de Nicotiana benthamiana e sua localização intracelular, a partir da fusão da proteína com proteínas de florescência para serem observadas por microscópio confocal. Com as construções mutantes podemos observar sintomas distintos como a ativação de lesões locais, murcha e tombamento, antes não verificados nos clones infecciosos originais. ORFN1/GFP mostrou localização associada ao reticulo endoplasmático.

MEMBROS DA BANCA:
Interna - 2222088 - ELIANE FERREIRA NORONHA
Externo à Instituição - RENATO DE OLIVEIRA RESENDE - OUTROS
Externo à Instituição - ROBERTO RAMOS SOBRINHO - UENF
Externa à Instituição - ROSANA BLAWID - UFRPE
Presidente - 1623558 - TATSUYA NAGATA