Análise de miRNA ́s circulantes identificados em pacientes com Carcinoma de Células Escamosa em Cavidade Oral e/ou Orofaringe
Sequenciamento de Próxima Geração. miRNA circulante. Biopsia Líquida. Carcinoma de Células Escamosa Oral e Orofaringe. Análise de Bioinformática.
Recentemente, a tecnologia de sequenciamento de próxima geração (NGS) está
revolucionando os estudos sobre miRNAs circulantes no câncer, pois permite a análise
global desses pequenos RNAs não codificantes em fluidos corporais, permitindo tanto a
detecção daqueles com baixa expressão quanto de novos. Neste estudo, identificamos
miRNAs circulantes associados ao CEC da cavidade oral e da orofaringe, e investigamos
ainda mais seus níveis de expressão in silico, previmos seus genes-alvo e identificamos
as vias biológicas que eles regulam.
Resultados A técnica RNA-seq foi aplicada em amostras de plasma para identificação
total de miRNAs. As análises bioinformáticas permitiram a identificação de seis miRNAs
proeminentes significativamente envolvidos com carcinoma espinocelular (CEC) de
cavidade oral e orofaringe: miR-30d-5p, miR-122-5p, miR-126-3p, miR-150-5p, miR-
191-5p e miR-223-3. Foram identificados um total de 194 genes alvo, previstos para estes
miRNAs, comuns às plataformas de predição TargetScan e miRDB. Posteriormente, uma
análise funcional desses genes, realizada pela ferramenta DAVID, destacou caminhos e
anotações com enriquecimento significativo. Entre eles, a via microRNAs no câncer, da
Enciclopédia de Genes e Genomas de Kyoto (KEGG) foi enriquecida. A partir da
Ontologia Genética (GO), foram enriquecidas as anotações do núcleo (Compartimento
Celular), ligação às proteínas (Função Molecular) e regulação negativa da transcrição
modelada pelo DNA (Processo Biológico). Além disso, a análise da Rede de Interação
Proteína-Proteína com STRING e Cytoscape permitiu a identificação de genes relevantes
para a doença estudada: PRKCA, RRAS2, RASA1, CALML4, PAX5 e FOXO1.
Conclusão Entre a complexa rede de miRNAs associados ao CEC de cavidade oral e
orofaringe, nosso experimento miRNoma e predição in silico de genes alvo, análises
funcionais e construção da rede PPI de miRNAs específicos destacaram o miR-150-5p e
o miR-223- 3p, fornecendo informações importantes sobre como eles podem modular a
expressão e a função dos genes no câncer oral e orofaríngeo. Estes resultados estabelecem
as bases para futuras investigações, incluindo estudos para validar o potencial destes
miRNAs como biomarcadores de diagnóstico ou prognóstico, ou alvos para o
desenvolvimento de novas abordagens terapêuticas.