Novas espécies e descobertas filogenéticas em Septoria no Brasil
Mycosphaerellaceae, 6 novos taxa, gama de hospedeiros, taxonomia, doenças de plantas
Septoria é um fungo fitopatogênico que causa manchas foliares em inúmeras espécies de plantas. Inicialmente, a delimitação das espécies era baseada em características morfológicas e especificidade de hospedeiro. Posteriormente, análises filogenéticas de diferentes regiões genômicas revelaram a ocorrência de espécies crípticas e inespecificidade do hospedeiro. Embora sete regiões genômicas sejam comumente usadas para identificação precisa, não há estudos que comprovem a eficácia do uso de tantas regiões. A falta de pesquisas sobre o sinal filogenético e a contribuição de cada região genômica resulta em um aumento no número de amostras necessárias, levando a custos mais elevados. Além disso, a falta de padronização no número de regiões genômicas usadas por diferentes grupos de pesquisa impede a comparação entre isolados de Septoria. O número elevado de espécies descritas, a baixa variação genética e a sobreposição de características morfológicas indicam a falta de critérios para determinar espécies em Septoria. Portanto, esse estudo tem o objetivo de descrever novas espécies e hospedeiras de Septoria e de estimar o sinal filogenético de sete regiões genômicas para a delimitação de espécies. Os isolados foram obtidos de manchas foliares em dez espécies de plantas coletadas nos estados do Ceará, Goiás, Pernambuco, Paraná, Rio de Janeiro, Santa Catarina, São Paulo e Distrito Federal. As regiões genômicas actina (act), calmodulina (cmda), β-tubulina (tub2), espaçador interno transcrito (its), fator de elongação 1-alpha (tef1), 28S nrDNA (lsu) e subunidade maior da RNA polymerase II (rpb2) foram analisadas seguindo o critério do reconhecimento de espécie filogenética por concordância genealógica. Entre os 41 isolados obtidos de hospedeiras de sete famílias botânicas (Apiaceae, Asteraceae, Araceae, Ericaceae, Iridaceae, Rosaceae e Vitaceae), apenas S. crepidis foi encontrada na mesma hospedeira previamente relatada no Brasil. As espécies S. cannabis e S. lycopersici foram relatadas em plantas de famílias botânicas distintas da hospedeira principal. Adicionalmente, seis espécies serão propostas de acordo com as regras do Código Internacional de Nomenclatura de algas, fungos e plantas. Enquanto Septoria sp.1 foi descrita em Petroselinum crispum (Apiaceae), Cissus verticillata (Vitaceae) e Philodendron imbe (Araceae); Septoria sp.2, Septoria sp.3, Septoria sp.4, Septoria sp.5, e Septoria sp.6 foram restritas à Rhododendron simsii (Ericaceae), Dietes bicolor (Iridaceae), Vernonia polysphaera (Asteraceae), Conyza sp. (Asteraceae) e uma hospedeira indeterminada, respectivamente. As regiões genômicas mais informativas para delimitação de espécies foram tef1, tub2, cmda, act, rpb2, its e lsu de acordo com a análise de informatividade filogenética, barcode gap e intra/inter-overlap. Baseado nesse estudo, coletas abrangentes e o sequenciamento das regiões genômicas tef1, tub2, cmda e act são essenciais para compreender a diversidade de espécies de Septoria em regiões tropicais.