Identificação e caracterização de novos vírus associados a ácaros do gênero Tetranychus (Acari: Tetranychidae)
ácaros; ácaros-aranha; Tetranychus; viroma; diversidade viral; RNA-seq; sequenciamento de alto rendimento; vírus assintomáticos; pragas agrícolas; controle biológico potencial.
Resumo em português: Artrópodes herbívoros, como ácaros e insetos, abrigam microrganismos que desempenham papéis centrais na estruturação de sua ecologia, adaptação e diversificação evolutiva. Embora vírus persistentes em insetos tenham sido amplamente descritos, o viroma de ácaros do gênero Tetranychus, importantes pragas agrícolas, permanece pouco explorado. Este estudo teve como objetivo caracterizar o conjunto de vírus persistentes associados a três espécies de relevância agronômica (T. truncatus, T. ogmophallos e T. urticae), empregando dados de sequenciamento de alto desempenho integrados a análises bioinformáticas in silico. No Capítulo 1, em T. truncatus, foram identificados três vírus de RNA fita simples senso positivo relacionados a picornavírus em transcriptomas de indivíduos assintomáticos analisados comparativamente. T. truncatus-associated iflavirus 1 (TtAIV-1) apresenta características compatíveis com uma nova espécie do gênero Iflavirus. Já T. truncatus-associated virus 1 (TtAV-1) e TtAV-2 possuem genomas bicistrônicos contendo dois elementos IRES, sugerindo a existência de linhagens virais ainda não classificadas. A abundância relativa desses vírus variou entre populações naturais e tratamentos experimentais, indicando dinâmicas específicas dependentes do contexto ecológico. No Capítulo 2, em T. ogmophallos, três vírus de RNA foram identificados após enriquecimento viral e sequenciamento, incluindo um iflavírus e dois nodavírus. T. ogmophallos iflavirus 1 (ToIV-1) formou uma linhagem filogeneticamente distinta dentro do grupo, enquanto T. ogmophallos nodavirus 1 (ToNV-1) e ToNV-2 apresentaram ambos os segmentos genômicos (RNA1 e RNA2), com proporções conservadas entre si. A abundância de ToIV-1 foi aproximadamente 37 vezes superior à de ToNV-2, sugerindo diferenças marcantes nas dinâmicas replicativas e possivelmente nas interações competitivas entre vírus coexistentes. A detecção desses vírus em indivíduos assintomáticos levanta hipóteses sobre relações hospedeiro-vírus potencialmente estáveis e ecologicamente relevantes. No Capítulo 3, em T. urticae, quatro segmentos correspondentes a um novo alfanudivírus altamente divergente foram detectados por meio de análises transcriptômicas aprofundadas. O perfil transcricional revelou variação na atividade entre segmentos e genes virais, além da presença de homólogos de genes de artrópodes intercalados a genes típicos de nudivírus e genes exclusivos adicionais. Esses achados sugerem a ocorrência de infecções latentes ou de baixa prevalência e reforçam a hipótese de que diferentes espécies do gênero Tetranychus abrigam conjuntos virais específicos. Em conjunto, os resultados ampliam substancialmente o conhecimento sobre a diversidade viral associada a Tetranychus, evidenciando a complexidade e especificidade dos viromas em ácaros fitófagos. Esses dados fornecem bases conceituais e moleculares para investigações futuras sobre interações vírus-hospedeiro e seu potencial impacto no manejo sustentável de pragas agrícolas, incluindo possíveis aplicações biotecnológicas.