Banca de DEFESA: JHON ERIC ALVES FERNANDES

Uma banca de DEFESA de DOUTORADO foi cadastrada pelo programa.
DISCENTE : JHON ERIC ALVES FERNANDES
DATA : 31/07/2026
HORA: 14:00
LOCAL: Auditório nº 03 do Instituto de Ciências Biológicas - IB
TÍTULO:

"Descoberta e evolução de novos vírus em plantas usando dados de sequenciamento de alto desempenho."

PALAVRAS-CHAVES:

Diversidade viral; Genômica; Bioinformática; Mineração de vírus.

PÁGINAS: 106
RESUMO:

Short Read Archive (SRA- acervo de leituras curtas em inglês) é um banco de dados em franca ascensão que armazena dados brutos de sequenciamentos genômicos. A evolução constante de métodos computacionais combinada com a popularização de arquiteturas de computação em nuvem permitiram um acesso fácil e escalonável a esses dados, abrindo novas perspectivas de pesquisa. Uma dessas novas perspectivas é a busca de vírus presentes nos dados das amostras sequenciadas que escaparam às análises iniciais. Essa tese implementou protocolos de análise computacional para analisar dados genômicos armazenados no SRA que foram testados em dois projetos. O primeiro projeto focou na família Deltaflexiviridae, pois é um grupo pouco estudado dentro da ordem Tymovirales que contém vários vírus que infectam plantas de grande importância econômica. Nosso método revelou que 82 dos 202 acessos continham 112 prováveis novos genomas virais. Nossos resultados fornecem evidências filogenéticas adicionais para a existência de uma família sugerida previamente, Emraviridae, e também a divisão da família Deltaflexiviridae e a criação de duas novas famílias: Zetaflexiviridae e Epsilonflexiviridae. O segundo projeto focou em amostras depositadas de Ora-pro-nóbis, uma planta alimentícia não convencional. Seis dos oito acessos analisados continham 7 genomas virais pertencentes a duas famílias: Caulimoviridae e Alphaflexiviridae. Nossos resultados esclarecem aspectos importantes da evolução da ordem Tymovirales e abrem novas questões a respeito da taxonomia do grupo e evidencia a importância de estudar a diversidade viral em plantas exploradas por comunidades locais.

MEMBROS DA BANCA:
Interna - 2222088 - ELIANE FERREIRA NORONHA
Externo à Instituição - ERICH YUKIO TEMPEL NAKASU - EMBRAPA
Externa à Instituição - MARILIA SANTOS SILVA PATRIOTA - EMBRAPA
Interna - 1723060 - RITA DE CASSIA PEREIRA CARVALHO
Presidente - 1623558 - TATSUYA NAGATA