Banca de QUALIFICAÇÃO: JOÃO LUCAS DA SILVA CORREIA

Uma banca de QUALIFICAÇÃO de MESTRADO foi cadastrada pelo programa.
DISCENTE : JOÃO LUCAS DA SILVA CORREIA
DATA : 25/09/2026
HORA: 14:00
LOCAL: C-Biotech
TÍTULO:

"SELEÇÃO E CARACTERIZAÇÃO IN SILICO DE AMIDASES BACTERIANAS CANDIDATAS À TRANSFORMAÇÃO DE COMPOSTOS RELACIONADOS ÀS POLIAMIDAS"

PALAVRAS-CHAVES:

poliamida-6; poliamida-6,6; amidases; família Amidase Signature;

biodegradação; bioinformática estrutural.

PÁGINAS: 86
RESUMO:

As poliamidas, especialmente a poliamida-6 (PA-6) e a poliamida-6,6 (PA-66), são polímeros sintéticos amplamente utilizados em diferentes setores industriais, mas apresentam elevada recalcitrãncia ambiental devido à estabilidade das ligações amida, à formação de ligações de hidrogênio e à organização semicristalina da matriz polimérica. Considerando a necessidade de estratégias complementares para a transformação de compostos relacionados a esses materiais, este trabalho teve como objetivo prospectar e avaliar, por meio de abordagem in silico, amidases bacterianas da família Amidase Signature com potencial aplicação na modificação ou degradação de compostos derivados de PA-6 e PA-66. As sequências analisadas foram obtidas a partir dos genomas de isolados bacterianos associados a resíduos plásticos do Cerrado, incluindo Comamonas brasiliensis PE63, Delftia sp. PEl38 e Stenotrophomonas sp. PE59l. Para isso, foram realizadas etapas integradas de seleção e curadoria de sequências bacterianas anotadas como amidases, validação funcional por CLEAN, Pfam e HMMER/hmmscan, confirmação do domínio PF0l425, análise de conservação de motivos catalíticos, avaliação de vizinhança genômica, predição de localização subcelular, alinhamento múltiplo, análise comparativa com enzimas de referência, modelagem estrutural e caracterização de bolsos catalíticos, túneis e canais de acesso por ferramentas como AlphaFold2, fpocket, DogSiteScorer, P2Rank/PrankWeb, CAVER e MOLE. Os resultados permitiram distinguir sequências com maior suporte funcional daquelas sem confirmação do domínio Amidase Signature, além de evidenciar diferenças estruturais relevantes entre as candidatas avaliadas. Entre as enzimas priorizadas, WP_249333655.l apresentou o perfil mais promissor, reunindo conservação catalítica, bolsão catalítico mais amplo, composição química favorável e melhor acessibilidade estrutural por túneis; WP_2ll455530.l apresentou perfil intermediário, enquanto WP_2l2646l87.l exibiu características mais restritivas, sendo mantida como comparativa estrutural. Assim, os resultados indicam que a integração de dados de sequência, contexto genômico e estrutura constitui uma estratégia adequada para priorizar amidases bacterianas com plausibilidade funcional para futuras etapas de docking molecular, dinàmica molecular, proposição de mutações e engenharia enzimática voltadas à transformação de compostos relacionados às poliamidas.

MEMBROS DA BANCA:
Interna - 2222088 - ELIANE FERREIRA NORONHA
Externo à Instituição - FABYANO ALVARES CARDOSO LOPES - UFT
Presidente - 1661623 - RICARDO HENRIQUE KRUGER