Avaliação funcional do knockout de SETD4 por CRISPR/Cas9 em leucemia linfoide aguda
Metiltransferase, Epigenética, Leucemia Linfoide Aguda.
Apresenta elevada heterogeneidade molecular, e evidências crescentes indicam que mecanismos epigenéticos influenciam a proliferação e a resposta terapêutica. A metiltransferase SETD4 regula a metilação de lisinas em histonas e modula programas transcricionais associados à carcinogênese. Este trabalho tem como objetivo avaliar o papel biológico de SETD4 em modelos celulares de LLA e investigar sua associação com proliferação celular e resposta ao Metotrexato (MTX). Inicialmente, analisamos dados transcriptômicos das plataformas TCGA, cBioPortal e BloodSpot para examinar o padrão de expressão de SETD4 e identificar vias enriquecidas em pacientes com alta e baixa expressão. Em seguida, conduzimos experimentos funcionais em duas linhagens de LLA-B: Nalm-6, de baixa expressão endógena de SETD4, e REH, cuja expressão é elevada. Na Nalm-6, induzimos a superexpressão de SETD4 por meio de vetor de expressão; na REH, reduzimos a expressão do gene utilizando siRNA. Também desenvolvemos modelos iniciais utilizando CRISPR/Cas9 com vistas à geração futura de clones knockout. Avaliamos os efeitos dessas manipulações na proliferação celular e na sensibilidade ao MTX. Nossas análises in silico demonstram que SETD4 encontra-se superexpresso em um subconjunto de amostras de LLA-B, especialmente naquelas com a translocação t(12;21), e mostram que pacientes com alta expressão apresentam enriquecimento de vias proliferativas, incluindo E2F, G2/M checkpoint, MYC e reparo de DNA. Experimentalmente, observamos que a superexpressão de SETD4 aumenta a proliferação de Nalm-6, enquanto o silenciamento reduz a proliferação de REH, confirmando um papel próproliferativo. Além disso, verificamos que células com níveis elevados de SETD4 apresentam maior sensibilidade ao MTX, enquanto a redução da expressão diminui a resposta ao fármaco. Esses resultados indicam que SETD4 atua como regulador positivo da proliferação e da sensibilidade ao MTX em LLA-B, reforçando seu potencial como biomarcador e alvo molecular para investigações futuras.