Banca de QUALIFICAÇÃO: CAMILA SOUZA RODRIGUES

Uma banca de QUALIFICAÇÃO de DOUTORADO foi cadastrada pelo programa.
DISCENTE : CAMILA SOUZA RODRIGUES
DATA : 28/05/2025
HORA: 08:00
LOCAL: ICC
TÍTULO:

Título da tese: Ferramentas Genômicas Aplicadas à Exclusão de Paternidade e Rastreabilidade em Animais de Produção

PALAVRAS-CHAVES:

 Bos taurus; Bos indicus; Ovis aries; Capra hircus; recursos genéticos; genotipagem de SNPs.

PÁGINAS: 97
RESUMO:

Ferramentas estratégicas para o fortalecimento das cadeias produtivas e a conservação de raças localmente adaptadas incluem a rastreabilidade racial e os testes de exclusão de paternidade. Tais abordagens auxiliam na conservação de importantes recursos genéticos, sobretudo no contexto atual, em que as mudanças climáticas representam um grande desafio para a segurança alimentar global. O objetivo deste trabalho é desenvolver e validar painéis reduzidos de marcadores SNPs (Single Nucleotide Polymorphisms), voltados para a exclusão de paternidade e a rastreabilidade racial em Bos taurus, Bos indicus, Ovis aries e Capra hircus, considerando raças brasileiras alvo de conservação. Para isso, utilizou-se o BeadChip multi-espécies (EMBRAPA multispecies 65K Illumina Infinium 1 chip) para a seleção dos marcadores, priorizando aqueles altamente informativos e aplicáveis em contextos de genotipagem rápida e de baixo custo. No total, foram genotipadas amostras de DNA extraído a partir de sangue das principais raças de bovinos (N=302), ovinos (N=588) e caprinos (N=192) dos rebanhos brasileiros. A seleção das amostras levou em consideração a variabilidade genética das populações, sendo utilizadas amostras de animais distribuídos em diferentes unidades de conservação in situ da EMBRAPA, localizadas em diversas regiões do país. Os controles de qualidade foram conduzidos no software SVS (SNP & Variation Suite 8.10.0), e as análises genéticas realizadas nos programas GenAlEx 6.5, STRUCTURE 2.3.4 e Cervus 3.0.7. Essas análises visam à determinação da estrutura populacional, composição racial e eficiência na exclusão de paternidade. Até o momento, foram desenvolvidos painéis reduzidos para testes de exclusão de paternidade em bovinos, ovinos e caprinos, compostos por 100 SNPs cada. De modo geral, os painéis apresentaram probabilidade de exclusão combinada (PE) superior a 0,9999, alta taxa de chamada (≥99%), frequência do alelo menor (MAF) ≥0,30, ampla distribuição genômica e conformidade com o equilíbrio de Hardy-Weinberg (p > 0,05). Além disso, a média do conteúdo de informação polimórfica (PIC) de cada painel foi igual ou superior a 0,372, o que é considerado elevado para marcadores bialélicos. Esses resultados demonstram uma elevada informatividade, robustez estatística e confiabilidade dos painéis desenvolvidos para as espécies estudadas, considerando as especificidades genéticas das populações brasileiras. Complementarmente, evidenciam desempenho superior na genotipagem de raças localmente adaptadas, em comparação a tecnologias preexistentes, como o painel ISAG de exclusão de paternidade em bovinos, originalmente estruturado para raças europeias taurinas. Em síntese, a proposta objetiva disponibilizar ferramentas genômicas acessíveis e robustas, capazes de subsidiar o manejo genético de rebanhos, agregar valor comercial aos produtos de origem animal e contribuir para a conservação de recursos genéticos localmente adaptados. Tais ferramentas têm o potencial de fortalecer as estratégias de conservação genética e otimizar a produção animal, alinhando-se aos desafios ambientais contemporâneos.

Palavras-chave: Bos taurus; Bos indicus; Ovis aries; Capra hircus; recursos genéticos; genotipagem de SNPs.

MEMBROS DA BANCA:
Interno - ***.334.559-** - ALEXANDRE FLORIANI RAMOS - NÃO INFORMADO
Interna - 2172341 - CONCEPTA MARGARET MCMANUS PIMENTEL
Externo à Instituição - SAMUEL REZENDE PAIVA - EMBRAPA