Banca de QUALIFICAÇÃO: OLGA MAIRA MACHADO RODRIGUES

Uma banca de QUALIFICAÇÃO de DOUTORADO foi cadastrada pelo programa.
DISCENTE : OLGA MAIRA MACHADO RODRIGUES
DATA : 22/12/2023
HORA: 14:00
LOCAL: Sala Teams do PPGMT
TÍTULO:

Vigilância Genômica de tuberculose e de COVID-19 no Distrito Federal com transporte de amostras por drone.

PALAVRAS-CHAVES:

vigilância genômica, co-infecção, tuberculose, COVID-19.

PÁGINAS: 70
RESUMO:

 

Introdução: Tuberculose (TB) e COVID-19 e são duas doenças infecciosas que se configuram como graves ameaças à Saúde Pública. Há evidências científicas de que casos co-infectados por TB e COVID-19 tenham piores desfechos. Objetivos: Investigar casos de co-infecção TB-COVID no Distrito Federal, diagnosticados de 2021 a 2023, elucidando aspectos clínicos, epidemiológicos e genômicos que possam impactar nos desfechos, além de testar a viabilidade de transportar amostras respiratórias por drone. Métodos: Este estudo contém componentes epidemiológico, genômico e de inovação. O banco de casos de tuberculose confirmados de 2021 e 2023 pelo Lacen-DF será linkado ao de COVID-19 para encontrar casos de coinfecção. O linkage será realizado com o Software R, pelas variáveis nome, data de nascimento e nome da mãe. Os elegíveis serão contactados por telefone e, posteriormente, presencialmente, para obtenção do termo de consentimento livre e esclarecido (TCLE). Os que aceitarem participar serão incluídos e investigados por meio de registros eletrônicos clínicos (no prontuário eletrônico Trakcare), epidemiológicos (no SINAN e no E-SUS VE) e laboratoriais (Trakcare ambiente laboratorial e GAL). Aqueles que tiverem isolados viáveis de Mycobacterium tuberculosis (Mtb) armazenados no Lacen-DF serão sequenciados pelo método Illumina®, buscando identificar, em comparação com a cepa H37Rv, sua origem filogenética, clusters genômicos, mutações relacionadas à drogarresistência e polimorfismos de nucleotídeo único (SNP) que possam ter relação com a COVID-19. Os resultados do sequenciamento serão analisados através de Pipeline computacional de Bioinformática, envolvendo etapas de filtragem, mapeamento e anotação, com uso de Sistema Operacional Linux e Softwares de sequenciamento genômico do R. Os achados serão validados junto à Rede Genômica Fiocruz. As anotações serão verificadas nas principais bibliotecas genômicas para Mtb. Adicionalmente, amostras de escarro (positivas para Mtb) e de swab (positivas para COVID-19) serão transportadas via drone, mantidas as devidas condições de biossegurança e segurança de voo, para testar a viabilidade desse transporte, considerando a qualidade das amostras. Resultados parciais: O projeto obteve parecer favorável do CEP da FEPECS. O Núcleo de Bacteriologia do Lacen-DF já compartilhou os bancos de dados dos casos de tuberculose, de 2021 a 2022, pois a base de 2023 ainda não está consolidada. Foram realizadas etapas iniciais de curadoria dos dados, com exclusão de duplicidades, identificando-se 352 casos de tuberculose com amostras armazenadas no Lacen-DF. As próximas etapas são a busca do nome da mãe e da data de nascimento dos casos para linkage com o banco de caso de COVID-19 do Lacen-DF. Para as análises genômicas, já estão sendo providenciados os materiais e insumos laboratoriais. O experimento com o drone ocorrerá após a obtenção da lista final de pacientes co-infectados por TB-COVID elegíveis, com os devidos TCLE. Foi realizada uma revisão de escopo sobre o uso de VANT (veículos aéreos não-tripulados, mais conhecidos como drones) no transporte de amostras respiratórias, sendo que o artigo foi submetido à revista científica Drones e aguarda avaliação. Está em curso outra revisão (sistemática) sobre o sequenciamento genômico de Mtb, em que se procura identificar os melhores métodos para sequenciamento genômico completo para Mtb.

MEMBROS DA BANCA:
Presidente - 2646005 - AMILCAR SABINO DAMAZO
Interna - ***.580.701-** - TAINA RAIOL ALENCAR - UnB
Externo à Instituição - RENAN PEDRA DE SOUZA - UFMG