Banca de DEFESA: Gustavo Henrique Silva Peixoto

Uma banca de DEFESA de DOUTORADO foi cadastrada pelo programa.
DISCENTE : Gustavo Henrique Silva Peixoto
DATA : 04/07/2024
HORA: 14:00
LOCAL: Videoconferência
TÍTULO:

Etiologia e genômica comparativa do agente causal da raiz rosada em alho e cebola

PALAVRAS-CHAVES:

diagnose, Alliaceae, taxonomia, Pyrenochaeta, Phoma.

PÁGINAS: 76
RESUMO:

A raiz rosada é a principal doença do alho e da cebola em plantios realizados em períodos de escassez hídrica e temperaturas elevadas, e/ou áreas com cultivos sucessivos de aliáceas. Embora a etiologia da raiz rosada não seja completamente esclarecida, os fungos habitantes do solo, Setophoma terrestris e Fusarium spp., são frequentemente associados com essa doença. Além dessa incerteza, vários estudos abordam visões conflitantes em relação a formação de clamidósporos e microescleródios em S. terrestris. Como o sequenciamento de populações e de genomas de diferentes espécies fúngicas revelam relações filogenéticas e adaptações ao ambiente, os objetivos desse estudo foram: (i) esclarecer a etiologia da raiz rosada do alho e da cebola; (ii) avaliar a patogenicidade dos isolados de Setophoma e Fusarium em raízes de alho e de cebola; (iii) avaliar a patogenicidade dos isolados de Fusarium spp. e Neocosmospora spp. em bulbos de alho e de cebola; (vi) sequenciar e anotar o genoma de S. terrestris usando as plataformas Illumina^® (short reads) e PacBio^® (long reads) e; (vii) identificar in silico os clusters de genes de biossíntese PKS relacionados à patogenicidade de S. terrestris. Os isolados foram obtidos de raízes de aliáceas e gramíneas com coloração púrpura intensa em sete estados brasileiros. O sequenciamento parcial do gene β-tubulina foi realizado para todos isolados enquanto isolados representativos foram selecionados para os testes de patogenicidade e a caracterização morfológica. A comparação de sequências do gene β-tubulina revelaram um clado de Setophoma (n=50) e dez clados de Fusarium/Neocosmospora (n=31). Os sintomas da raiz rosada foram visualizados em raízes de alho e cebola inoculadas com Setophoma enquanto raízes inoculadas com diferentes isolados de Fusarium permaneceram assintomáticas. A análise multigênica dos isolados patogênicos confirmaram somente S. terrestris causando raiz rosada em alho e cebola. Além disso, novos hospedeiros de S. terrestris foram relatados no Brasil. Como não se observou a formação de clamidósporos e microescleródios em S. terrestris, conclui-se que a presença de picnídios em raízes de várias hospedeiras e restos culturais são a única fonte de inóculo da raiz rosada.  Para compreender a diversidade de espécies de Fusarium e Neocosmopora associadas com a raiz rosada, isolados representativos foram inoculados em bulbos e identificados por análise multigênica de sequências parciais dos genes fator de elongação e RNA Polimerase II. Entre as dez espécies de Fusarium/Neocosmopora (F. acutatum, F. annulatum, F. elaeidis, F. fabacearum, F. lacertarum, F. languescens, F. nirenbergiae, N. bostrycoides, N. falciformis e N. solani), somente F. acutatum e F. languescens não causaram a podridão basal em bulbos de alho e cebola. O genoma de S. terrestris foi sequenciado e anotado, resultando em uma montagem de 47 Gb, na qual foram preditos 54 genes de biossíntese. A anotação dos genes de biossíntese PKS foi relacionada com fitotoxidez e micotoxidez em diferentes patossistemas, podendo ser importante no processo infeccioso de S. terrestris. As novas informações obtidas nesse estudo são fundamentais para melhoristas e fitopatologistas no desenvolvimento de genótipos de alho e cebola resistentes a raiz rosada, auxiliando no manejo eficiente da doença no campo.

MEMBROS DA BANCA:
Externa à Instituição - THAÍS REGINA BOUFLEUR - USP
Presidente - 2254987 - DANILO BATISTA PINHO
Externo à Instituição - EVERALDO ANTONIO LOPES - UFV
Externo à Instituição - SILVINO INTRA MOREIRA - UFU
Externo ao Programa - 3345176 - WILLIE ANDERSON DOS SANTOS VIEIRA - null