Banca de QUALIFICAÇÃO: BRUNO ARCANJO SILVA

Uma banca de QUALIFICAÇÃO de DOUTORADO foi cadastrada pelo programa.
DISCENTE : BRUNO ARCANJO SILVA
DATA : 21/03/2025
HORA: 08:30
LOCAL: Digital na plataforma Microsoft Teams
TÍTULO:

Levantamento de vírus associados a cucurbitáceas e caracterização de vírus associados ao "amarelão" do meloeiro

PALAVRAS-CHAVES:

Sequenciamento de alto rendimento; Cucurbitáceas; “amarelão” do meloeiro, vírus vegetal.

PÁGINAS: 25
RESUMO:

A família Cucurbitaceae é formada por 97 gêneros com 950 espécies de plantas. No Brasil, as principais espécies cultivadas são aquelas pertencentes aos gêneros Citrullus. (melancia), Cucumis (pepino, maxixe e melão), Cucurbita. (moranga, abóbora e abobrinha), Lagenaria (cabaça-caxi) e Sechium (chuchu). As viroses se destacam como as principais doenças das cucurbitáceas podendo ocorrer em altas incidências e em diferentes níveis de severidade, resultando em reduções drásticas na produção total e na qualidade dos frutos. No Brasil são relatados cerca de quatorze vírus que infectam cucurbitáceas e estes vírus podem ocorrer em infecção simples ou mista. Assim, o objetivo deste trabalho foi identificar novos vírus em um pool de cucurbitáceas (Citrullus spp., Cucumis spp., Cucurbita spp. e Sechium spp. utilizando high throughput sequencing (HTS). As amostras foram semi-purificadas e o RNA total foi extraído de um pellet obtido por centrifugação em almofada de sacarose, usando um QuickRNATM Plant MiniPrep Kit (Zymo Research, Irvine, EUA). Uma biblioteca de cDNA foi feita e sequenciada usando um sistema Novaseq na escala 10G. Os reads foram trimados e os contigs foram montados usando MEGAHIT. Foi realizado um BLASTx usando o banco de dados de proteínas virais (RefSeq 2023) na plataforma Geneious Prime. As análises mostraram a presença de 9 gêneros de vírus, Carlavirus, Cucumovirus, Badnavirus, Caulimovirus, Closterovirus, Coguvirus, Potyvirus, Polerovirus e Orthotospovirus. Além disso, dois contigs apresentaram maior identidade na sequência de aminoácidos (95,4% de 3124 aa na poliproteína e 87,2% de 203 aa na proteína P1) com o moroccan watermelon mosaic virus (MWMV), pertencente ao gênero Potyvirus da família Potyviridae, um vírus que não havia sido previamente relatado no Brasil. A presença deste vírus foi confirmada através de RT-PCR realizada com primers específicos, direcionados ao gene da CI (cylindrical inclusion - tamanho esperado de 598 pb). Uma amostra de Juazeiro/BA e cinco amostras de Petrolina/PE foram positivas para MWMV. Um replicon de cada região foi sequenciado (Juazeiro, OR338305; Petrolina, OR338306) e mostrou maior identidade nucleotídica de 97,0% entre si, e 96,4% e 97,7%, respectivamente, com o isolado do Marrocos (OQ847413). Este é o primeiro relato da ocorrência de MWMV no Brasil e na América do Sul, associado a sintomas de mosaico, formação de bolhas e amarelecimento em plantas de abóbora.

MEMBROS DA BANCA:
Presidente - 1623558 - TATSUYA NAGATA
Externo ao Programa - 1316471 - DANIEL MENDES PEREIRA ARDISSON DE ARAUJO - UnBExterno à Instituição - JORGE ALBERTO MARQUES REZENDE - USP
Externa à Instituição - Patrícia Valle Pinheiro - EMBRAPA
Externo à Instituição - RENATO DE OLIVEIRA RESENDE - OUTROS
Externa à Instituição - ROSANA BLAWID - UFRPE