"Desenvolvimento de novo meio semisseletivo e de LAMP para detecção e identificação de Xanthomonas citri pv. viticola, agente causal do cancro bacteriano da videira."
Vitis vinifera, Diagnose, PCR, Xanthomonas campestris pv. viticola.
O cancro bacteriano da videira, causado por Xanthomonas citri pv. viticola (Xcv), bactéria quarentenária presente no Brasil, é responsável por um dos principais problemas fitossanitários da cultura da videira (Vitis vinifera). A videira apresenta elevada importância econômica cuja área de cultivo no país tem se ampliado, incluindo o Distrito Federal, onde a viticultura vem se consolidando nos últimos anos. Registros oficiais de ocorrência da doença incluem Bahia, Ceará, Pernambuco, Roraima e, recentemente, no Rio Grande do Norte. O patógeno provoca cancros em hastes, ramos e pecíolos, além de lesões necróticas em folhas e bagas, comprometendo a produção. Suas colônias são arredondadas, convexas, brilhantes, com bordos lisos e coloração branca. Este estudo teve como objetivo aprimorar métodos de detecção e identificação de Xcv, visando maior rapidez, simplicidade, especificidade e sensibilidade. Para isso, foi realizada uma modificação na composição do meio semisseletivo NYDAM e o desenvolvimento da técnica de Amplificação Isotérmica Mediada por Loop (LAMP), ambos a partir da análise genômica de isolados indianos e brasileiros de Xcv. Com base na presença de genes de resistência a antibióticos presentes no genoma, foi selecionada a penicilina G para compor o meio, com a adição de cicloheximida para inibição do crescimento fúngico, originando o meio semisseletivo NYDAM+. O tamanho das colônias formadas foi significativamente menor quando comparado ao meio basal e ao meio 523. Na avaliação do meio, foi realizado teste de eficiência, obtendo-se 100,36% de recuperação em relação ao NYDAM. A comparação do isolamento de Xcv a partir de folhas inoculadas sintomáticas nos meios NYDAM e NYDAM+ demonstrou maior eficiência do meio aprimorado, que reduziu o número de colônias não alvo e a quantidade de fungos, facilitando a detecção da bactéria. Além disso, a recuperação de colônias de Xcv foi significativamente maior no meio NYDAM+ em duas das três plantas avaliadas. Paralelamente, seis conjuntos de primers foram desenhados com base em análises comparativas de genomas de Xcv depositados no NCBI, incluindo outras espécies do gênero Xanthomonas. O conjunto de primers ‘ 96_9055_133_ID19’ selecionado apresentou amplificação consistente a 65 °C por 60 minutos com limite de detecção de 3 ng/μL de DNA e 10⁴ UFC/mL. Embora com baixa sensibilidade, os primers demonstraram elevada especificidade, amplificando todos os isolados de Xcv testados, sem amplificação cruzada com isolados pertencentes ao gênero Xanthomonas e outras bactérias fitopatogênicas, incluindo Xylophilus ampelinus e Xylella fastidiosa, ambas bactérias quarentenárias ausentes no Brasil que afetam a videira. Por fim, foi possível detectar Xcv diretamente de folhas e pecíolos sintomáticos, dispensando a etapa de extração de DNA. Aliada à visualização imediata do resultado após a amplificação, a técnica se constitui em uma ferramenta mais simples e rápida de execução. Os resultados obtidos indicam que o meio NYDAM+ e a técnica LAMP desenvolvida constituem ferramentas promissoras e complementares para a detecção de Xcv, contribuindo para o diagnóstico mais rápido e específico do cancro bacteriano da videira.