Explorando o viroma do tomateiro e plantas associadas
Solanum lycopersicum; sequenciamento de alto rendimento; viroma; diversidade viral; Orthotospovirus; vírus de plantas.
O tomateiro (Solanum lycopersicum) é uma das principais hortaliças cultivadas no Brasil e está sujeito à infecção por uma ampla diversidade de vírus, capazes de ocorrer isoladamente ou em infecções mistas e causarem perdas na produção. Nesse contexto, o sequenciamento de alto desempenho (HTS) representa uma importante ferramenta para a caracterização abrangente da diversidade viral, possibilitando a detecção simultânea de vírus conhecidos e desconhecidos potencialmente emergentes. Este estudo teve como objetivo caracterizar a diversidade viral (viroma) associada a diferentes sistemas de cultivo de tomate, incluindo plantas daninhas que circundam a produção e investigar a ocorrência de vírus de importância fitossanitária. No primeiro capítulo, foram analisadas amostras provenientes de áreas produtoras de tomate de mesa, localizadas em Brazlândia e Taquara, no Distrito Federal, e de tomate industrial, em Cristalina, Goiás. As amostras foram submetidas ao sequenciamento de alto rendimento e os dados foram processados por meio de etapas de controle de qualidade, montagem de contigs e identificação taxonômica. Foram identificadas 26 espécies virais pertencentes a diferentes grupos taxonômicos, evidenciando elevada diversidade viral nas áreas avaliadas. A maior riqueza viral foi observada no cultivo de tomate mesa, com 25 espécies identificadas (sendo 21 exclusivas desse sistema e uma espécie do gênero Orthotospovirus ainda não relatada no Brasil). Em contrapartida, o tomate industrial apresentou cinco espécies, com uma exclusiva. As análises também indicaram diferenças na composição e abundância da diversidade viral entre os sistemas de cultivo, evidenciando uma distribuição heterogênea dos vírus associados ao tomateiro. No segundo capítulo, a abordagem de HTS, combinada a análises moleculares e filogenéticas, permitiu a detecção e caracterização de uma espécie do gênero Orthotospovirus não relatada no Brasil e associada à cultura do pimentão, ampliando o conhecimento sobre a diversidade viral no país. Em conjunto, os resultados demonstram a eficiência do sequenciamento de alto rendimento na caracterização de viroma vegetais e destacam sua aplicação como ferramenta para vigilância, detecção de vírus emergentes e compreensão da diversidade viral em diferentes sistemas de produção.