Banca de DEFESA: Paula Rodrigues Neves

Uma banca de DEFESA de MESTRADO foi cadastrada pelo programa.
STUDENT : Paula Rodrigues Neves
DATE: 28/07/2022
TIME: 13:30
LOCAL: Videoconferência
TITLE:

First report and characterization of the carlavirus potato virus P in tomato

KEY WORDS:

NGS; tomato; Solanum lycopersicum; potato virus P; PVP.

PAGES: 70
BIG AREA: Ciências Biológicas
AREA: Biologia Geral
SUMMARY:

As perdas causadas por doenças impactam de forma considerável a cultura do tomateiro. Dentre eles, as doenças virais destacam-se pela dificuldade de controle, resultando em redução da produtividade e aumento do custo de produção. Esse estudo tem como objetivo a caracterização molecular de um carlavírus identificado a partir de sequenciamento de alta performance ou de próxima geração – NGS, utilizando a plataforma Illumina HiSeq2000. Amostras de tomateiro coletadas no Rio Grande do Sul no ano de 2015 foram avaliadas. Detectou-se, nessas amostras, um vírus ainda não relatado em tomateiro, além de dois outros vírus já conhecidos. Focou-se no estudo deste vírus distinto. Análises envolveram a avaliação da qualidade dos reads, a montagem da sequência genômica, a determinação da estrutura genômica e análise de recombinação e relacionamento filogenético com outros vírus. Foi confirmado que o vírus é classificado como membro da espécie Potato virus P, do gênero Carlavirus. Verificou-se que isolados de potato virus P (PVP) foram anteriormente descritos infectando a batateira no Brasil, Argentina e Rússia. O vírus detectado em tomateiro é mais semelhante ao isolado russo com 95,55 % de identidade de nucleotídeos. A organização genômica é típica de um carlavírus com 6 ORF’s, sendo a sequência determinada incompleta, faltando a extremidade terminal 5’ e 3’. Na análise filogenética, o PVP de tomateiro foi agrupado com os demais isolados de PVP de batateira. Foi possível observar um potencial evento de recombinação, também presente no isolado da Rússia, mas ausente nos isolados do Brasil e da Argentina. Este é o primeiro relato do PVP em infecção natural em tomateiro, sendo que estudos adicionais são necessários para avaliar os potenciais danos que esse vírus causa ao tomateiro.

BANKING MEMBERS:
Externo à Instituição - MILTON LUIZ DA PAZ LIMA
Externa à Instituição - ALICE KAZUKO INOUE NAGATA
Interna - 1723060 - RITA DE CASSIA PEREIRA CARVALHO
Interna - 3117540 - THAIS RIBEIRO SANTIAGO