Dinâmica evolutiva de potato virus Y e seu efeito na amplitude de hospedeiros.
potyvirus, PVY, ONT, adaptação a hospedeiro, evolução de vírus.
O potyvírus potato virus Y (PVY) é um dos principais vírus fitopatogênicos, principalmente na cultura da batata. Recentemente, viroses associadas a PVY estão sendo frequentemente relatadas em tomateiros e pimenteiras. Além da carência de dados básicos da doença nessas culturas, pouco se conhece sobre a dinâmica evolutiva dos vírus em adaptação nessas plantas na área agrícola. Propõe-se aqui a análise genômica de isolados de PVY de batata, pimentão e tomate. Estes isolados serão utilizados para identificação de cultivares de tomateiro e pimentão com resistência à infecção por PVY, assim como a determinação de potenciais fontes de inóculo no campo. A seguir, um ensaio de inoculações sequenciais de 3 isolados (um de cada cultura) será conduzido para determinar a capacidade adaptativa desses isolados nos diferentes hospedeiros em distintas combinações (homóloga, não homóloga, mista e alternada). Serão no mínimo 9 gerações sequenciais com avaliações quanto à taxa e velocidade de infecção, sintomas e variação genômica, em comparações entre si e com o isolado inicial; em análises genômicas e de diversidade genética de populações virais em evolução. As conclusões preliminares serão confirmadas a partir de novos ensaios. A primeira parte dos ensaios biológicos e a determinação das sequências genômicas será realizada no Brasil. No período de seis meses de doutorado sanduíche no Instituto de Biologia Integrativa de Sistemas (I2SysBio, CSIC) sob a supervisão do Dr. Santiago Elena, as análises de bioinformática serão realizadas utilizando a estrutura computacional avançada da I2SysBio e novos ensaios biológicos serão realizados. Essas análises envolverão também sequências disponíveis em bancos de dados públicos, contendo >700 sequências de genoma completo de PVY. Este projeto de colaboração será importante para fornecer dados que serão usados para a formulação de estratégias de manejo cultural de PVY nas 3 culturas e promover a parceria entre a Embrapa, UnB e o I2SysBio da Espanha. O programa de doutorado sanduiche depende da aprovação da solicitação de bolsa para o programa CAPES-PRINT e, em caso de aprovação, será iniciado em março de 2023.